Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl5Q5DTT4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl5Q5DTT4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms