Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT1

Nexmif, Neurite extension and migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexmifQ5DTT1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NexmifQ5DTT1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms