Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f8Q58FA4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms