Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms