Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc47Q505F5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc47Q505F5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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