Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trp53i11Q4QQM4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms