Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5935Q497S0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms