Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ulk4Q3V129 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms