Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc110Q3V125 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms