Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Garnl3Q3V0G7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms