Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3V0E1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms