Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc27Q3V036 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms