Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms