Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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