Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nkain3Q3URJ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkain3Q3URJ8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms