Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms