Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec31aQ3UPL0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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