Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tmem253Q3UNB8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem253Q3UNB8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem253Q3UNB8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem253Q3UNB8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmem253Q3UNB8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem253Q3UNB8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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