Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms