Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5113Q3UGK8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5113Q3UGK8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm5113Q3UGK8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5113Q3UGK8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms