Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr41Q3UDP0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms