Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttll12Q3UDE2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll12Q3UDE2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms