Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms