Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms