Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ulk3Q3U3Q1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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