Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Serac1Q3U213 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms