Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc174Q3U155 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms