Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms