Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl4Q3TZA2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms