Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a5Q3TYU2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a5Q3TYU2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms