Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms