Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uri1Q3TLD5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms