Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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