Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtf2f1Q3THK3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtf2f1Q3THK3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms