Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms