Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms