Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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