Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ptchd1Q14B62 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ptchd1Q14B62 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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