Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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