Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Spatc1Q148B6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spatc1Q148B6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms