Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms