Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms