Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21bQ0HA38 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms