Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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MestQ07646 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MestQ07646 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MestQ07646 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MestQ07646 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MestQ07646 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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MestQ07646 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms