Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms