Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms