Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms