Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Thbs3Q05895 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thbs3Q05895 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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