Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox12Q04890 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms