Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox10Q04888 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox10Q04888 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms